北京大学肿瘤医院内镜中心是国内肿瘤专科医院中最早成立的独立内镜专业诊疗科室之一。经过30余年的发展，内镜中心作为隶属于大外科、面向全院提供全流程内镜诊疗服务的平台科室，形成了以消化及呼吸内镜介入诊疗为特色的肿瘤专科内镜中心，业务涵盖：早期消化道肿瘤内镜下精查、消化道早期肿瘤内镜下切除（ESD、双镜联合手术及其他ESD衍生技术）、深部组织脏器病变穿刺活检（EUS-FNA、EBUS-TBNA、EBUS-GS-TBLB）、胆道良恶性梗阻治疗（ERCP、EUS-BD、胆道镜下肿瘤光动力消融）、消化道梗阻诊疗（支架置入、肠梗阻导管、狭窄扩张、胃造瘘、营养管置入/瘘引流）、气道梗阻处理（支架置入、消融再通）、硬质气管镜检查、双气囊小肠镜检查、经口胆道镜检查及胶囊内镜检查等，其中多项技术处于国际及国内领先地位。截至2024年底内镜中心共有医师14人、护理21人、医学技术员1人、医学秘书1人、博士后1人、工勤人员1人；其中主任医师4人，副主任医师2人，主治医师5人，住院医师3人；硕士研究生导师2人。科室成员专业学会任职包括：中华医学会消化内镜学分会全国委员及青年委员、中国抗癌协会肿瘤内镜专委会副主任委员、CSCO光动力专委会副主任委员及胃肠间质瘤专委会委员、中国医师协会消化内镜分会委员、北京医学会消化内镜学分会常委及青年委员等。科室团队成员多次在国内外专业学术会议中进行主题报告、手术演示、壁报分享等。内镜中心于2025年成为国家卫健委消化内镜医师脱产培训项目首批合作单位，同时作为北京医学会消化内镜学分会消化内镜培训中心及国家消化道早癌防治中心联盟单位，近5年面向全国培训进修医师/学员60余人，并承担北京市“慢病健康管理·癌症筛查与早诊培训”项目，累计培训学员超240人。近10年来，内镜中心先后承担国家自然科学基金项目、科技部国家重点研发计划项目及首都卫生发展专项计划多项，并承担来自北京市科学技术委员会、北京市医院管理局、北京市委组织部的科研项目/课题30余项，研究项目经费累计494万。先后发表SCI论文40余篇，影响因子170余分，发表北大核心期刊10余篇。组织并参与了国内多项内镜诊疗指南/共识的制定。自2024年起，内镜中心承担国家级区域医疗中心建设，于内蒙古院区及云南院区固定派驻科室成员，长期定点帮扶当地内镜诊疗事业，获得了分院其他科室广泛认可，以及当地患者的众多好评。